Egy titokzatos rejtett gént találtak a koronavírus génjén belül, és nem tudják, hogy miért van ott

A kutatók egy titokzatos gént fedeztek fel a koronavírus SARS-CoV-2 genetikai kódjában - ez a szegmens gyakorlatilag el van rejtve a vírus g...

A kutatók egy titokzatos gént fedeztek fel a koronavírus SARS-CoV-2 genetikai kódjában - ez a szegmens gyakorlatilag el van rejtve a vírus genomjában, és eddig nagyrészt figyelmen kívül hagyták.

Az újonnan azonosított gén - az úgynevezett ORF3d - egy példa az úgynevezett átfedő génre: egyfajta "gén egy génben," amely hatékonyan el van rejtve egy sor nukleotidban, mert átfedi egymást más gének kódolt szekvenciáival. (1)

"A genom méretét tekintve a SARS-CoV-2 és hozzátartozói a létező leghosszabb RNS vírusok közé tartoznak," - magyarázza Chase Nelson bioinformatikus az Amerikai Természettudományi Múzeumból.

"Így talán hajlamosabbak a 'genomikus trükkökre,' mint más RNS vírusok."

A vírusok valójában meglehetősen hajlamosak átfedő gének befogadására, így ez nem éppen sokkoló felfedezés. Annak megválaszolása, hogy az ORF3d valóban genomi trükköket képvisel-e, még várat magára, de mindenesetre mindenképpen trükkös dolog látni.

Az átfedő géneket nehéz azonosítani a genetikai szekvenciákban, mivel a genetikai szkennelési rendszerek gyakran kihagyhatják őket, amikor a genetikai kód húrjain futnak: az egyes gének felvételére vannak programozva, de nem feltétlenül látnak átfogó utasításokat a szomszédos gének nukleotidjai között egy szekvenciában.

Az olyan vírusok összefüggésében, mint a SARS-CoV-2, ezek komoly vakfoltot eredményezhetnek. A tudósok az év eleje óta versenyeznek, hogy minél többet megértsenek erről a pusztító vírusról, és bár genetikai felépítésének egyes aspektusait sikerült tisztázni (beleértve azt a szilárd konszenzust, hogy nem "laboratóriumban készült"), sok dolog maradt, amit még most sem tudunk.

"Az átfedő gének figyelmen kívül hagyása veszélybe sodorhatja a vírusbiológia fontos szempontjait," - mondja Nelson.

"Az átfedő gének egyike azon módszereknek, amelyek révén a koronavírusok fejlődnek, hogy hatékonyan replikálódjanak, hogy meghiúsítsák a gazdaszervezet immunitását vagy továbbterjedjenek."

Ami az ORF3d-t illeti, még sok mindent meg kell tudni arról, hogy miért van ott, miért rejtőzik a genomban és fogják közre más gének.

A genomikai adatbázisokat átkutatva a kutatók megállapították, hogy a gént már korábban is azonosították, de csak a koronavírus egyik változatában, amely a tobzoskaféléket érinti (a kínai Kuanghsziban található meg).

Korábban tévesen osztályozták rokon génnek az ORF3b-t, amely más koronavírusokban, köztük a SARS-CoV-ban is jelen van, de valójában nem ugyanazok.

"A két gén nem kapcsolódik egymáshoz, és teljesen különböző fehérjéket kódolnak," - mondja Nelson. "Ez azt jelenti, hogy a SARS-CoV ORF3b-ről szóló ismereteket nem szabad alkalmazni a SARS-CoV-2 ORF3d-re."

Egy dolgot tudunk a titokzatos génről az emberi COVID-19 betegekkel végzett korábbi vérvizsgálatok alapján, hogy az ORF3d erős antitest választ vált ki.

Hogy a T-sejteket is aktiválja-e - vagy az átfedő ORF3d milyen más vírusos célokat szolgálhat -, ezzel kapcsolatban még mindig sötétben tapogatózunk. Lehet, hogy viszonylag jóindulatú. Lehet, hogy nem.

"Még nem ismerjük a funkcióját, vagy van-e klinikai jelentősége," - mondja Nelson.

"De azt jósoljuk, hogy ezt a gént viszonylag valószínűtlen, hogy T-sejtes válasz fogja kimutatni, ellentétben az antitestválasszal. És talán ennek köze van ahhoz, hogy a gén hogyan tudott létrejönni."

Egy biztos. Egy olyan vírusban, amelynek csak körülbelül 15 ismert génje van, egy másik felfedezése - nemhogy egy átfedő géné - jelentős előrelépés. Hogy mennyire jelentős, a tudósok most megpróbálják kideríteni. (2)

(1) - https://elifesciences.org/articles/59633
(2) - https://www.amnh.org/about/press-center